Su Ürünleri Fakültesi, 1982 yılında 41 Sayılı Kanun Hükmünde Kararname ile 4 yıllık Yüksekokul olarak Ondokuz Mayıs Üniversitesi bünyesinde kurulmuştur. Eğitim ve öğretime 1984 –1985 eğitim – öğretim yılında Samsun’da başlayan ve Mart 1986 yılında Sinop’a nakledilen Yüksekokulumuz 1992 yılı içerisinde Fakülte haline dönüştürülmüştür. Fakültemiz, 29 Mayıs 2007 gün ve 26536 sayılı Resmi Gazetede yayınlanarak yürürlüğe giren ve 5662 sayılı Kanunla kurulan Sinop Üniversitesi’ne bağlanmıştır. Akademik yapılanma bakımından Su Ürünleri Temel Bilimler Bölümü, Su Ürünleri Yetiştiriciliği Bölümü, Su Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Bölümü olmak üzere 3 Bölümden ve 7 Anabilim Dalından oluşan Fakültemizde lisans eğitiminin yanı sıra lisansüstü (Yüksek Lisans ve Doktora) eğitim de verilmektedir. Fakültemizde 2024 yılı itibariyle 17 Profesör, 6 Doçent, 14 Dr. Öğretim Üyesi ve 3 Araştırma Görevlisi olmak üzere 40 akademik ve 18 idari personel görev yapmaktadır.

Fakültemiz yerleşkesi 13.748 m²’lik alanda, A ve B Blok olmak üzere iki binada hizmet vermektedir. Fakültemizde 4 Amfi, 1 Konferans Salonu, 4 Derslik, 10 Araştırma Laboratuvarı, 1 Bilgisayar Laboratuvarı, 2 Akvaryum Ünitesi, 1 Araştırma ve Uygulama Merkezi ile Denizde Midye ve İstiridye Yetiştiricilik Tesisi yer almaktadır. Bilimsel çalışmalarda ve öğrenci uygulamalarında kullanılan R/V-Seydi Ali Reis (22,5 m), R/V-Aurelia (11 m) ve R/V Sufak-82 (14,5 m) isimli üç adet araştırma teknesi bulunmaktadır. Fakültemiz yerleşkesi içerisinde, halı saha, voleybol sahası, basketbol sahası ve tenis  kortundan oluşan spor tesisi; kafeterya ve yemekhane bulunmaktadır. Fakültemize kayıt yaptıran öğrenciler 4 yıllık uygulamalı lisans eğitiminden sonra "Su Ürünleri Mühendisi" unvanı kazanmaktadır.